LPM IAI Miftahul Ulum Pamekasan merupakan unit strategis yang bertanggung jawab mengembangkan, menerapkan, dan mengevaluasi Sistem Penjaminan Mutu Internal (SPMI) di lingkungan institusi. LPM berperan memastikan seluruh kegiatan akademik maupun non-akademik berjalan sesuai standar nasional pendidikan tinggi, sehingga mutu layanan, tata kelola, dan proses pembelajaran senantiasa meningkat secara berkelanjutan.